深海熒光計包括通過透鏡與激勵濾光片光學連接的光源，與記錄濾光片光學連接的樣品池和記錄系統(tǒng)，其中，光源是脈沖式的，記錄系統(tǒng)是三通道式的，每一通道都包含一光電接收器，光電接收器與選通積分器連接，選通積分器的輸出端與模數轉換器相連，所述光電接收器中之一經緩沖放大器與模數轉換器連接，所有的選通積分器都與測量選通脈沖整形器連接，模數轉換器及測量選通脈沖整形器與控制裝置連接，所述控制裝置與顯示裝置連接。
深海熒光計在使用時，需要注意開機次序，以保護設備之間不受影響。深海熒光計開機順序一般為先開氙燈，然后開儀器主機，后開跟儀器連接的計算機。如此操作的原因在于穩(wěn)態(tài)氙燈是高壓點亮，為了避免瞬問脈沖電流對周圍設備造成影響，需要先開氙燈，等電流穩(wěn)定后再打開周邊的電腦等設備。
深海熒光計的工作原理是光源氙弧燈發(fā)出的光通過切光器使其變成斷續(xù)之光以及激發(fā)光單色器變成單色光后，此光即為熒光物質的激發(fā)光，被測的熒光物質在激發(fā)光照射下所發(fā)出的熒光，經過單色器變成單色熒光后照射于測樣品用的光電倍增管上，由其所發(fā)生的光電流經過放大器放大輸至記錄儀。
在用深海熒光計測定某些會引起熒光改變的微量物質時，常采用差示熒光法，可使熒光強度的讀數差距拉大，使熒光強度的降低加大，從而提高方。
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